Подготовила Надежда Кузнецова
Выявить вирус Эбола у пациентов с симптомами геморрагической лихорадки теперь можно в полевых условиях. Новый тест разработала группа под руководством доктора Стергиоса Мошоса (Sterghios Moschos) в Нортумбрийском университете.
Во время вспышки Эбола в Африке в 2014 году образцы крови пациентов отправлялись для исследования в специализированные лаборатории с высококвалифицированным персоналом. В мире существует всего несколько таких лабораторий, где обнаружение генома вируса Эбола занимает от 5 до 8 часов.
Благодаря усилиям исследовательской группы доктора Мошоса, работающей совместно с BioGene Ltd, была разработана новая диагностическая платформа EbolaCheck, которую можно использовать прямо на месте вспышки. Тест проводят на количестве крови в 700 раз меньшем, чем требовалось ранее: достаточно одной капли крови, а сам анализ занимает менее 70 минут. Метод намного безопаснее и проще в использовании, кроме того, значительно снижает стоимость диагностики. Важно, что его эффективность сопоставима с лабораторными исследованиями, то есть любой пациент с симптомами лихорадки Эбола может быть безопасно и надежно диагностирован.
В своей работе группа доктора Мошоса показала возможность выявления РНК возбудителя непосредственно в крови или сыворотке, без предварительной её обработки и очистки РНК. Для разрушения вирусных частиц и высвобождения вирусной РНК использовали контролируемое, низкотемпературное замораживание-оттаивание, а затем в той же пробирке проводили RT-qPCR. Проблему ингибирования RT-qPCR решали с помощью оптимизации реагентов и выбора флюорофоров. В ходе работы также была создана рабочая станция «QuRapID» представляющая собой термоциклер из 8 мини-станций, где можно проводить исследование до 8-ми образцов крови одновременно и независимо друг от друга. На рисунке представлена принципиальная схема прибора.
Исследование финансировалось грантом по программе Elrha Research for Health in Humanitarian Crises (R2HC). Использованная в исследовании технология разработана и запатентована компанией BioGene Ltd предоставляющей комплексные решения для молекулярной биологии, включающие очистку нуклеиновых кислот, амплификацию и пост-амплификационный анализ.
Технологию возможно использовать и в диагностике других особо опасных вирусов, таких как вирус Зика, МЕРС, SARS, вирусы гриппа и денге, а также бактериальных и паразитарных инфекций, например, менингита и малярии. Доктор Стергиос Мошос, доцент кафедры клеточной и молекулярной биологии Нортумбрийского университета, сказал: «Во время вспышки Эбола, между 2013 и 2016 годами, заразились более 28 500 человек, при этом уровень смертности составил 39,5%. Людям часто приходилось идти пешком по несколько часов, чтобы добраться до передвижных лечебных центров, или ждать сутками результаты анализа. Иногда пациенты с симптомами других заболеваний, таких как малярия, подвергались риску заражения, находясь рядом с инфицированными вирусом Эбола пациентами в ожидании ответа из лаборатории».
Источник
Kavit Shah et al. // Field-deployable, Quantitative, Rapid Identification of Active Ebola Virus Infection in Unprocessed Blood. // Chem. Sci., 2017; DOI: 10.1039/C7SC03281A
Показать все 0 комментария