address2arrow-email-sendarrow-rightbtn-right-arrowbubbleclosecomment-arrow-answerenvelopeeyefriendshamburgerheartHeart copy 26heart-emptyhomehumanlikelk-bubblelk-eyeHeart copy 26lk-pencilloginnav-editnav-eyenav-newsnav-starnav-userloginnext-arrow-rightpagination-lastpagination-nextShape 19 copysearchstarstar-fulluserBriefcaseCard
10 Сентября, 2018

Обзор научной периодики за 3–9 сентября

Война с резистентными бактериями, жидкая ДНК вирусов, метилирование ДНК и ревматизм, микробиом легких, молекулярная биология фазы быстрого сна, метаболом и аутизм, теломеры и подъем по лестнице, а также открытие доступа к научным статьям.

Художник: Наталья Дюкова

Художник: Наталья Дюкова

Литературу изучала Екатерина Харыбина

1. Наше новое потенциальное преимущество в гонке вооружений с бактериями, приобретающими резистентность к антибиотикам. Суть метода, названного CHAOS (Controlled Hindrance of Adaptation of OrganismS), заключается в изменении экспрессии сразу многих генов с помощью CRISPR-Cas9, что тормозит эволюцию штамма и развитие им резистентности. Результаты исследования опубликованы в журнале Communications Biology; подробнее в нашей новости.

2. В Национальном институте рака выяснили, что соматические мутации и сигаретный дым, стимулируя канцерогенез, изменяют микробиоту легкого. Чтобы сравнить состав микробиоты, исследователи секвенировали бактериальные 16S рибосомные РНК из образцов нормальной легочной ткани и опухолевой. Было показано, что, например, в случае сквамозной карциномы и мутации гена TP53 в легких увеличивается количество бактерий рода Acidovorax. Эти данные дают возможность более ранней диагностики рака легких.

3. В статье из eLife описан механизм влияния состояния ДНК фага на тип развития инфекции в клетке. Исследователи, изменяя условия внешней среды, показали, что более мобильное — «жидкое» — состояние вирусной ДНК при высокой температуре и концентрации положительно заряженных ионов способствует развитию латентного типа инфекции.

4. В Nature опубликованы результаты масштабного исследования взаимодействий вируса Зика и нейронных клеток. Выявлены сотни белков, с которыми взаимодействует возбудитель, и тысячи сайтов фосфорилирования. Показано, что вирус Зика воздействует на важнейшие сигнальные пути, такие как AKT, MAPK-ERK и ATM-ATR.

5. В Cell Reports вышла статья, авторы которой доказали важность работы мускариновых рецепторов ацетилхолина для продолжительности фазы быстрого сна (REM-фазы). Эта фаза характеризуется повышенной активностью головного мозга и у людей часто сопровождается яркими сновидениями. С помощью метода CRISPR с тремя мишенями были получены мыши с выключенными генами ацетилхолиновых рецепторов Chrm1 и Chrm3; у таких мышей наблюдалось снижение общего времени сна за счет сильного сокращения REM-фазы.

6. В статье, опубликованной в Molecular Cell, описан неканонический путь активации иммунной системы при повреждении ДНК в эпителиальных клетках этопозидом. Факторы, реагирующие на повреждение, стимулируют работу белка STING, который в свою очередь активирует синтез клеткой цитокинов, привлекающих иммунные клетки, — по сути, развивается иммунный ответ на повреждение собственной ДНК, отчасти сходный с реакций на нуклеиновые кислоты возбудителей инфекции. Так организм может бороться с озлокачествлением клеток кожи, постоянно находящихся в стрессовых условиях.

7. Сокращение длины теломер в старости приводит не только к нарушению функционирования многих органов, но и к снижению физических функций, что отражено в статье из Frontiers in Physiology. Проанализировав данные об активности и длине теломер лейкоцитов у пожилых женщин и мужчин, исследователи пришли к выводу, что при критическом сокращении теломер у людей появляются ограничения физической активности. (Ограничения определяли с помощью стандартного опросника, а также измеряли силу мышц кисти.) В исследовании приняли участие более 1200 человек из пяти европейских стран.

8. В Molecular Cell предложен новый метод детекции формирования агрегатов гентингтина (FRASE) при болезни Гентингтона с использованием FRET. Авторы работы также показали, что именно небольшие волокна, формируемые мутантным белком, в первую очередь способствуют образованию агрегатов. Метод можно использовать в диагностике заболевания, возможно, эти результаты будут способствовать разработке лекарств.

9. В Genome Medicine опубликовано исследование, в котором показаны различия в метилировании ДНК у монозиготных близнецов, дискордантных по ревматоидному артриту. На основании полученных данных, ученые предложили новую модель, которая отражает изменение профиля метилирования ДНК в результате ответа клеток на стресс, что, в свою очередь, влияет на развитие ревматоидного артрита и других аутоиммунных заболеваний.

10. В рамках проекта CAMP (Children's Autism Metabolome Project) сделаны первые успехи в диагностике расстройств аутистического спектра (РАС) на основе анализа метаболома. Исследователи, чья статья опубликована в Biological Psychiatry, сравнив образцы крови детей с РАС и здоровых детей, обнаружили признаки нарушения метаболизма глицина, глутамина и орнитина у 17% больных. Открытие может облегчить диагностику на ранних стадиях, когда еще не проявляются изменения в поведении, и может стать ключевым в разработке диагностических панелей для выявления РАС.\

11. CRISPR и технологии генного редактирования: в центре внимания — успехи Sangamo Technologies в генной терапии синдрома Хантера; см. новость на PCR.ru. Компании Vertex Pharmaceuticals и CRISPR Therapeutics вместе работают над фазой 1/2  клинических испытаний основанной на CRISPR терапии бета-талассемии. Две группы исследователей — под руководством Дженнифер Дудны (Университет Калифорнии, Беркли) и Джозефа Бонди-Деноми (Университет Калифорнии, Сан-Франциско) нашли 15 новых ингибиторов CRISPR.

12. Новости компаний, работающих в сфере биотехнологий, медицины и молекулярной диагностики. Большой интерес у молекулярно-диагностических компаний вызвала программе Horizon 2020 Еврокомиссии, ориентированная прежде всего на разработку тестов для выявления рака, инфекционных и сердечно-сосудистых заболеваний; работа программы в 2014—2017 гг. освещена в Personalized Medicine. Компания 23&Me, работающая напрямую с потребителями, планирует добавить к услугам по генотипированию секвенирование геномов клиентов. А крупнейшая биотехнологическая компания Thermo Fisher намеревается выкупить собственных акций на сумму 2 млрд. долларов.

Приятным завершением обзора станет новость про реализацию права на информацию в области научных публикаций. Предложено радикальное решение проблемы открытого доступа к научным статьям. 11 организаций, спонсирующих научные исследования в Европе (общая сумма грантов 7,6 млрд. евро ежегодно), подписали декларацию, названную «План S» — S от science, speed, solution, shock. Декларация требует от грантополучателей предоставления бесплатного доступа к статьям и призывает отказаться от публикаций в журналах, не обеспечивающих открытый доступ, в том числе в Science и Nature. Естественно, эта новость вызвала споры, но большинство комментаторов согласно с тем, что наука должна стать более открытой.

337
0
Лидеры мнений
Лидеры отрасли
  • FUTURE
    13
САМЫЕ ОБСУЖДАЕМЫЕ ТЕМЫ ФОРУМА
Поиск материалов по тегам