address2arrow-email-sendarrow-rightbtn-right-arrowbubbleclosecomment-arrow-answerenvelopeeyefriendshamburgerheartHeart copy 26heart-emptyhomehumanlikelk-bubblelk-eyeHeart copy 26lk-pencilloginnav-editnav-eyenav-newsnav-starnav-userloginnext-arrow-rightpagination-lastpagination-nextShape 19 copysearchstarstar-fulluserBriefcaseCard
2 Декабря, 2017

Раскрыты детали взаимодействия возбудителя Ку-лихорадки с белками клетки млекопитающих

Сотрудники Института Крейга Вентера, а также армии и министерства обороны США создали обширную базу данных, в которой содержится информация о взаимодействиях белков Coxiella burnetii с белками клетки-хозяина.

Иллюстрация: wikipedia/commons

Иллюстрация: wikipedia/commons

Подготовила Надежда Кузнецова

Бактерия Coxiella burnetii — возбудитель Ку-лихорадки, в большинстве случаев она не смертельна, однако коксиеллы могут использоваться в качестве биологического оружия, в том числе террористами. Отсюда интерес к этому заболеванию военных и оборонных ведомств. Сотрудники Института высокопроизводительных компьютерных программных приложений для биотехнологии (Biotechnology High Performance Computing Software Applications Institute, BHSAI), Центра телемедицины и современных технологий (Telemedicine & Advanced Technology Research Center, TATRC) а также Института Крейга Вентера получили огромный массив новой информации о взаимодействии белков C. burnetii с белками клетки хозяина.

Для проникновения внутрь хозяйской клетки C. burnetii использует эффекторные белки, они необходимы также для создания вакуоли, где происходит активное размножение возбудителя. На сегодня известно более 100 таких эффекторных белков.

Авторы отобрали для исследования 33 белка C. burnetii. Критериями отбора служили наличие генов этих белков у патогенных штаммов (Nine Mile I RSA493, Heinzerling RSA331, Dugway 5J108-111, G Q212, and K Q154), а также секретируемость  белка. Затем с помощью двугибридной дрожжевой системы проводили скрининг выбранных белков против протеомных библиотек человека и мыши.  Всего было обнаружено 273 взаимодействия между 20 эффекторными белками C. burnetii и 247 белками человека, а также 157 между 17 белками патогена и 137 белками мыши. Авторы провели анализ сигнальных путей и процессов в клетках хозяев, исследовали связь эффекторов с фенотипами инфекции и выявили потенциальные механизмы взаимодействия для белков-эффекторов с неизвестными функциями. В результате они смоделировали профиль молекулярных взаимоотношений патоген — хозяин (клетка человека). 

Полученная в этой работе база данных по взаимодействию коксиеллы с клеткой-хозяином — богатейшая на сегодня; это ценный источник информации для всех, кто занимается данным патогеном или более общими вопросами молекулярных механизмов инфекции.

Процессы и сигнальные пути клетки, на которые влияют эффекторные белки C. burnetii. Сигнальные пути распределены на 5 групп в зависимости от клеточного процесса: процессинг РНК, процессинг белков, пути деградации, сигналинги (в том числе вовлеченные в иммунный ответ), метаболизм. Размер звездочек отражает количество целевых белков для каждого пути передачи сигнала.


Источник

Wallqvist А. et al. // Mechanisms of action of Coxiella burnetii effectors inferred from host-pathogen protein interactions. // PLoS One. 2017 Nov 27;12(11):e0188071, DOI: 10.1371/journal.pone.0188071. eCollection 2017.


1039
0
Лидеры мнений
Лидеры отрасли
  • FUTURE
    13
САМЫЕ ОБСУЖДАЕМЫЕ ТЕМЫ ФОРУМА
Поиск материалов по тегам